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双绿源基因芯片助力油菜营养品质研究

 时间:2025-03-21

近日,中国农业科学院油料作物研究所王汉中院士团队在《Plant Biotechnology Journal》发表了题为“An alternative splicing caused by a natural variation in BnaC02.VTE4 gene affects vitamin E and glucosinolate content in rapeseed (Brassica napus L.)”的研究论文。研究揭示了BnaC02.VTE4 基因的自然变异通过选择性剪接影响维生素E(VE)和硫代葡萄糖苷(GSL)含量的分子机制,为油菜营养品质育种提供了新思路。作为基因分型技术的核心支持者,双绿源的Bnapus50K油菜基因芯片在此研究中发挥了重要作用。

一、研究背景

维生素E(VE)是植物和动物必需的重要抗氧化剂,其中α-生育酚(α-T)是人体内生物活性最高的形式。油菜籽油富含α-T,但其合成机制及与硫代葡萄糖苷(glucosinolate)代谢的关联尚不明确。本研究通过解析BnaC02.VTE4 基因的自然变异,揭示了其对油菜中VE和硫代葡萄糖苷含量的调控机制。

二、亮点解析

1. 维生素E的遗传调控

(1)通过不完全双列杂交和GWAS分析,发现油菜籽中VE含量主要由胚胎基因型控制,母体效应较弱。

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图1 油菜籽中维生素E相关性状的遗传分析

(展示不同亲本(高VE与低VE)及其杂交后代的VE含量差异,以及遗传方差分析(胚胎基因型主导))

(2)鉴定到关键QTL qVE.C02,其表型贡献率高达18.71%,并确定目标基因为BnaC02.VTE4(编码γ-生育酚甲基转移酶)。

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图2 甘蓝型油菜维生素E相关性状的全基因组关联分析

(结果显示 qVE.C02 的位置(Manhattan图、LD热图)及关联SNP(seq-new-rs31838)的表型效应,直接对应QTL的鉴定和表型贡献率描述)

2. 基因变异的分子机制

(1)BnaC02.VTE4 存在两种单倍型:

① Hapl1(高VE):正常剪接,功能完整。
② Hapl2(低VE):在第二个内含子的3'剪接位点发生A→G点突变,导致选择性剪接(保留内含子或异常剪切),翻译提前终止,丢失关键功能域Ubie_methyltran,从而阻碍γ-T向α-T的转化。
通过遗传互补实验证实,Hapl1可恢复拟南芥突变体(atvte4-4)和低VE油菜品种(如85088)的VE和α-T含量(提升90%-307%)。

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图3 BnaC02.VTE4 的鉴定与功能验证

(对比两种单倍型(Hapl1与Hapl2)的序列差异,并通过拟南芥互补实验(图3b,c)证明Hapl1的功能完整性)

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图4 BnaC02.VTE4 功能变异的鉴定

(详细解析点突变(A→G)导致的选择性剪接(HapL-T1/T2)及翻译提前终止(图4b,c),并通过突变体互补实验(图4e,f)验证该突变的因果性)

3. 对硫代葡萄糖苷代谢的影响

(1)Hapl2导致VE合成受限,酪氨酸和甲硫氨酸代谢流向硫代葡萄糖苷途径,显著增加其含量。

(2)多组学分析显示,Hapl2中硫代葡萄糖苷相关基因(如CYP83A1、MAM1)表达上调,代谢物积累增加。

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图5 转录组与代谢组联合分析

BnaC02.VTE4-Hapl2中硫代葡萄糖苷相关基因(如CYP83A1、MAM1)表达上调,代谢物积累增加(图6d-f),并验证其与VE含量的负相关性(图6g-i))

三、育种应用潜力

1. BnaC02.VTE4-Hapl1在驯化过程中被优先选择(尤其在冬性油菜中),其基因型频率在育成品种中高达94.71%。

2. 利用功能标记C02Vte4可同时提高VE含量、降低硫代葡萄糖苷含量,并可能增强抗逆性,为油菜品质改良提供新策略。

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图6 BnaC02.VTE4HapH的育种潜力分析

(展示BnaC02.VTE4-Hapl1在自然群体、育成品种及不同生态型中的分布频率(图7a-d),证明其在驯化中的正向选择,尤其是冬性油菜中的高频率)

四、创新与意义

1. 首次揭示BnaC02.VTE4 通过选择性剪接调控VE合成的分子机制,并阐明其与硫代葡萄糖苷代谢的拮抗关系。

2. 开发的功能分子标记可加速高VE、低硫代葡萄糖苷油菜品种的选育,提升食用油营养价值和作物抗逆性。

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图7 BnaC02.VTE4调控维生素E与硫苷代谢的工作模型



本研究中,双绿源自主研发的Bnapus50K 油菜基因芯片凭借其高通量、高精度的基因分型能力,成功用于327份油菜种质资源的基因型-表型关联分析,不仅加速了QTL qVE.C02的定位,还为功能标记开发奠定了数据基础,助力育种家快速筛选优良单倍型(HapH),实现维生素E提升与硫代葡萄糖苷降低的“双优”目标。




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